Zadebiutował w zespole Trampy. Współpracował m.in. z zespołem Extra Ball, Tomaszem Stańko, Zbigniewem Seifertem, Janem „Ptaszynem” Wróblewskim, Zbigniewem Namysłowskim, Andrzejem Kurylewiczem, Wojciechem Karolakiem oraz Januszem Muniakiem. W czasie studiów w RFN był stałym członkiem tria Włodka Pawlika, z którym nagrał m.in. album „Standards Live”.
Zbigniew Wegehaupt stworzył również własny kwartet, z którym nagrał dwie znaczące płyty „Wege” oraz „Tota”. Czytelnicy pisma „Jazz Forum” wielokrotnie wybierali go najlepszym polskim kontrabasistą. Komponował muzykę teatralną i filmową, m.in. do filmu „Enen” Feliksa Falka czy „Wrony” Doroty Kędzierzawskiej. Współpracował ze Stanisławem Sojką przy płytach „Blublula”, „Sojka Sings Ellington” i „Matko, która nas znasz”. W 1992 roku wraz z Grzegorzem Ciechowskim nagrał płytę „Obywatel świata”. Brał udział w nagraniach muzyki jazzowej, rozrywkowej i filmowej. Był wykładowcą w klasie kontrabasu na Wydziale Jazzu w Państwowej Szkole Muzycznej II st.w Warszawie.
Wystąpił na wielu festiwalach jazzowych w kraju i za granicą, m.in. Jazz Jamboree, Warsaw Summer Jazz Days, Festiwalu Jazzowym w Hadze, Red Sea Jazz Festiwal, Bilbao Jazz Festiwal oraz Festiwalu Jazzowym w Dusseldorfie.
W TVP Kultura prezentujemy rejestrację koncertu jazzowego z udziałem Zbigniewa Wegehaupta i muzyków młodego pokolenia z 14 grudnia 2009 roku w warszawskim klubie Palladium. To podróż do muzycznego świata, w którym zacierają się granice między jazzem a muzyką współczesną.
Emisja 11 lutego, godz. 22.50, TVP Kultura